俳優・菅田将暉が主演する日本テレビ系連続ドラマ『3年A組―今から皆さんは、人質です―』（毎週日曜 後10：30）、3日放送の第9話から物語はいよいよ最終章へと突入する。舞台は一度時を変え、生徒たちの数年後へ。それぞれの人生を歩み、再び教室に集まってきた生徒たちの前に飾られていたのは菅田演じる、かつて自分たちを人質にとった担任・柊一颯（菅田）の遺影だった…。

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　これまでこの物語では卒業式の10日前、校舎を爆破して3年A組の生徒と教室を孤立させた一颯は自殺した女生徒・景山澪奈（上白石萌歌）の死の真相を探るべく命をかけた最後の授業の模様を描いてきた。徐々に明らかになっていくその真実、そして一颯の教えに、変化していく生徒たち。

　第9話で生徒たちがもう一度、教室に集まった理由。それは、亡き一颯の三回忌だった。そこで、逢沢（萩原利久）が撮影してきた澪奈のドキュメンタリー映像の全容が流されることになる。次々に明らかになる澪奈の真実。その映像に映し出される澪奈の本当の想いとは…。
　　　　　　
そして時は生徒たちが高校3年生である、元の3月9日へと戻る。一颯は、郡司を人質にとった後、意識を失ってしまう。SNSでは武智（田辺誠一）が澪奈を殺した犯人とされて炎上が続き、マスコミは武智を追いかける。そんな中、ある人物が、一颯が作ったフェイク動画をSNSに投稿。武智糾弾の流れはその動画により一颯「真犯人」説に形を変え、一斉に矛先を変えていく。

　その状況を見つめていた生徒たちが狼狽する中、目を覚ました一颯が教室に現れる。そして、一颯は3年A組に向かって、「全ての真実を話す授業」を始めることになる。